嘔吐毒素檢測方法有薄層色譜法、高效液相色譜法、柱凈化法結合電子捕獲檢測設備的氣相色譜法、高效液相色譜串聯質譜法、放射性免疫測定法等；Casale等則提出了酶聯免疫檢測方法。下面簡單介紹幾種方法。

       1、薄層色譜法是采取的谷物及其制品中嘔吐毒素檢測的方法，其檢測限為1mg/kg。適用于谷物（小麥、玉米、大麥等）及其制品（蛋糕、餅干、面包等）。薄層色譜法雖然操作簡便，曾得到較廣的應用，但是，處理樣品時工作量大；在檢測過程中操作人員需要直接接觸標準品，危害到操作人員的身體健康，而且本方法在提取過程中需要使用大量的溶劑，這樣就會對周圍環境也會產生不利影響；靈敏度差，增加靈敏度需要改進樣品的提取和凈化方法，改進和增強薄層色譜分析性能，這樣就增加了勞動強度和檢測成本。 

       2、酶聯免疫吸附法靈敏、準確、可定量、操作簡便、不用貴重儀器設備，且對樣品純度要求不高，比較適用于大批量樣品的檢測，發展快。簡化了樣品預處理和純化過程。但是由于免疫酶的活躍度不穩定，在應用過程中很容易受到操作條件的影響，反應試劑需低溫保存。在實際操作過程中基本達不到這一要求，使得免疫酶的活躍度大大降低，從而影響到結果的準確性。應用時還需要通過多次洗滌，才能使反應產物和游離底物進行分離，影響到結果的重復性，而且檢測時間較長。

       3、高效液相色譜法和氣相色譜可以對樣品中的嘔吐毒素檢測進行定性定量分析。測定DON需進行衍生化，通過三甲硅烷衍生物，利用電子捕獲檢測設備進行定量分析，操作繁瑣、重現性較差。而且這兩種方法所需色譜儀、檢測設備等比較昂貴，而且樣品前處理比較復雜，操作時需要人員，不便推廣應用。另外，也不適合大批量樣品的檢測。